LA TRASCRIZIONE NELLA SINTESI PROTEICA

Trascrizione può essere schematicamente diviso in tre fasi: inizio, allungamento e terminazione.

La trascrizione può iniziare solo in corrispondenza di particolari regioni di DNA chiamate promotori.

Ciascun promotore è composto da diverse sequenze. Una di esse è la TATA box, ricca di adenina e timina.

Tra adenina e timina vi sono due legami a idrogeno e non tre, come tra citosina e guanina. Questo fa sì che sia più facile separare le basi e aprire la doppia elica.

È proprio dalla TATA box che ha inizio la trascrizione con l'intervento dei fattori di trascrizione.

Queste proteine regolatrici, legandosi alla TATA box, cambiano forma e inducono dei cambiamenti conformazionali nel DNA.

A questo punto si aggiungono altri fattori di trascrizione e l'RNA polimerasi, l'enzima che catalizza la sintesi dell'RNA. Si forma così il complesso di inizio della trascrizione.

Uno dei fattori del complesso apre la doppia elica di DNA nel punto di inizio. Si forma un complesso aperto.

L'RNA polimerasi comincia a unire i nucleotidi formando un filamento di RNA. Viene aggiunto un nucleotide alla volta, usando il DNA come stampo.

Il criterio di scelta del nucleotide è l'appaiamento delle basi azotate. Una base purinica si appaia sempre con una base pirimidinica.

Osserviamolo nel dettaglio. In basso vediamo il DNA con la catena di zuccheri e le basi azotate rappresentate dalle lettere. In alto l'RNA in formazione.

L'uracile è appaiato all'adenina e la citosina alla guanina. Uracile e citosina vengono legati tra loro in corrispondenza dei rispettivi zuccheri e così i nucleotidi via via aggiunti.

Il carbonio in posizione 3' si lega al carbonio in posizione 5' del nucleotide successivo e si liberano acqua e pirofosfato.

Durante la fase di allungamento, l'RNA polimerasi si muove lungo il filamento di DNA, svolgendo la doppia elica e riavvolgendola dietro di sé. Quando la catena di RNA raggiunge la lunghezza di circa 20 nucleotidi, la sua estremità 5' viene modificata chimicamente attraverso un processo detto capping, che vedremo meglio in seguito.

La fase finale della trascrizione è detta terminazione.

La terminazione si verifica quando la RNA polimerasi, scorrendo sul filamento di DNA, incontra delle particolari sequenze, dette sequenze di arresto o terminatrici.

A questo punto, il filamento di RNA viene rilasciato e la polimerasi si dis