Trascrizione eucarioti — Transcript

Spiegazione dettagliata della trascrizione nei eucarioti, con focus su regolazione genica, RNA polimerasi e fattori di trascrizione.

Key Takeaways

  • La trascrizione è un processo complesso e finemente regolato essenziale per la corretta espressione genica.
  • Gli elementi cis e in trans collaborano per controllare l'attività trascrizionale.
  • Le modifiche degli istoni e i complessi di rimodellamento cromatinico influenzano l'accessibilità del DNA.
  • Le diverse RNA polimerasi sintetizzano tipi specifici di RNA con funzioni cellulari distinte.
  • I fattori di trascrizione generali sono indispensabili per l'inizio della trascrizione nei eucarioti.

Summary

  • Importanza della regolazione della trascrizione genica negli eucarioti per evitare malattie e squilibri cellulari.
  • Differenza tra elementi cis (promotori, potenziatori) ed elementi in trans (proteine regolatrici).
  • Ruolo dei fattori di trascrizione generali e specifici nel facilitare l'inizio della trascrizione.
  • Funzione della fosforilazione della coda CTD dell'RNA polimerasi per l'attivazione della trascrizione.
  • Descrizione dei co-attivatori, co-repressori e complessi di rimodellamento della cromatina.
  • Modifiche istoniche che regolano la formazione di eucromatina o eterocromatina.
  • Presenza di tre RNA polimerasi negli eucarioti con funzioni distinte (RNA polimerasi 1, 2 e 3).
  • Tipi di RNA prodotti: mRNA, rRNA, tRNA, snRNA, snoRNA, miRNA, siRNA e altri RNA regolatori.
  • Dettaglio sul meccanismo di trascrizione mediato da RNA polimerasi 3 e fattori di trascrizione TF3B e TF3C.
  • Formazione di complessi proteici e condensati biomolecolari fondamentali per la regolazione genica.

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Speaker A
Sogno un mondo migliore. Uno in cui l'istruzione non sia un miraggio ma un diritto.
00:30
Speaker A
Oggi parleremo di un mega argomento che è la trascrizione. Prima ancora di cominciare la trascrizione a livello degli eucarioti, facciamo dei mini accenni, però fondamentali per capire cosa c'è sotto a tutto ciò, sull'importanza della regolazione della trascrizione dei geni a livello degli eucarioti. Andrò velocissimo e se hai già visto questo video, salta pure. Se no, magari ferma e cerca di capire piano piano questi processi. Allora, abbiamo visto che dal DNA del gene, noi otteniamo RNA tramite la trascrizione e poi tramite la traduzione andiamo ad ottenere delle proteine. Se non avviene tutto ciò, mi può andare a dare vari problemi, come l'eccessiva produzione di proteine mi può andare a dare o malattie date da accumuli, o anche dei tumori attivandomi oncogeni, o posso utilizzare energia a vuoto, o ancora, per esempio, in cellule specializzate endocrine a produrre eccessivi ormoni che quindi mi andranno a dare squilibri enormi. Poi, abbiamo definito elementi cis ed elementi in trans. Gli elementi in cis sono quelli intrinseci al DNA, come il promotore o il potenziatore, potenziatori di trascrizione, e gli elementi in trans sono quell'insieme di proteine che vanno ad inserirsi qui. Successivamente abbiamo visto che ci sono i fattori di trascrizione che sono generali o specifici. Quelli generali sono come il binario che mi si va a formare per far sì che la mia RNA polimerasi possa porsi a livello di questo binario, quindi il mio treno, e possa successivamente partire, perché? Perché fanno varie funzioni. Oltre ad individuare la zona dove inserirsi, quello che vanno a fare è fosforilare questa coda CTD, ed è come se stiano dando l'elettricità e la corrente per far muovere questo treno. Tutto ciò verrà letto da un mediatore che andrà a ricollegare il tutto, e le ultime due cose che ci mancano sono i co-attivatori e co-repressori e complessi di rimodellamento. I co-attivatori, principalmente, vanno ad effettuare delle modifiche che portano a favorire l'espressione di un l'espressione di un gene. Avremo dei co-attivatori che mi andranno ad acetilare, dove? A livello dei nucleosomi, noi abbiamo un insieme di istoni. A livello degli istoni, per esempio, H3, abbiamo una coda. Su questa coda andiamo ad effettuare una modifica sul codice istonico, quindi sul codice di aminoacidi, noi andiamo ad effettuare una modificazione che può darmi un'informazione sia di attivazione, quindi di formazione di eucromatina, sia di repressione, puoi dirmi, no, non abbiamo bisogno di questo gene, quindi richiudere il tutto. E tutto ciò verrà letto da qualcun altro, che chi è quest'altro? Sono altre proteine, che sono dei complessi di rimodellamento, che possono essere o di lettura o di azione, che andranno successivamente a essere raccordati da questo mediatore e formarmi questo enorme condensato biomolecolare che ha una funzione importantissima per il nostro organismo. Ora, vediamo la fase della trascrizione.
06:39
Speaker A
Eccoci qua.
06:43
Speaker A
La trascrizione del DNA. Come dice il termine, noi andiamo a prendere un tratto del DNA, in questo caso, andiamo ad individuare un gene e andiamo a trascriverlo. Il fine di trascriverlo sarà ottenere un RNA che ci sarà utile a livello della nostra cellula e che potrà avere tantissime vie.
07:02
Speaker A
Allora, incominciamo dicendo che a livello degli eucarioti, noi abbiamo ben tre RNA polimerasi, non una, quindi tre enzimi che vanno a sintetizzare questi tratti. Abbiamo l'RNA polimerasi 1, 2 e 3, e ognuna di loro avrà una sua funzione.
07:35
Speaker A
Allora,
07:36
Speaker A
mettiamo qui.
07:37
Speaker A
Famiglie.
07:38
Speaker A
Numero uno.
07:39
Speaker A
Famoso e indiscusso.
07:40
Speaker A
mRNA.
07:41
Speaker A
Anche conosciuto come.
07:42
Speaker A
RNA messaggero.
07:43
Speaker A
Ora, come dice il termine, è un messaggero.
07:44
Speaker A
Questo vuol dire che mi sta trasportando un'informazione.
07:45
Speaker A
E poi la vedremo.
07:46
Speaker A
Successivamente.
07:47
Speaker A
Abbiamo.
07:48
Speaker A
Gli.
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Speaker A
rRNA.
07:50
Speaker A
Conosciuti anche come.
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Speaker A
RNA ribosomiali.
07:52
Speaker A
Ancora.
07:53
Speaker A
Abbiamo.
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Speaker A
I.
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Speaker A
tRNA.
07:56
Speaker A
Conosciuti come.
07:57
Speaker A
RNA transfer.
07:58
Speaker A
E.
07:59
Speaker A
Ne abbiamo ancora altri.
08:00
Speaker A
Ne cito qualcuno.
08:01
Speaker A
Abbiamo.
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Speaker A
Gli.
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Speaker A
snRNA.
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Speaker A
Che sono gli.
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Speaker A
Small nuclear RNA.
08:06
Speaker A
O ancora.
08:07
Speaker A
Abbiamo.
08:08
Speaker A
Gli.
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Speaker A
snoRNA.
08:10
Speaker A
Che sono.
08:11
Speaker A
Small nucleolar RNA.
08:12
Speaker A
O ancora ci sono delle altre classi.
08:13
Speaker A
Mettiamole qua.
08:14
Speaker A
Abbiamo.
08:15
Speaker A
I miRNA.
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Speaker A
Che sono.
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Speaker A
I micro RNA.
08:18
Speaker A
Come abbiamo.
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Speaker A
I siRNA.
08:20
Speaker A
Che sono i signaling RNA.
08:21
Speaker A
E poi in realtà ci sono degli altri tratti di RNA che si possono formare.
08:22
Speaker A
Per esempio, possiamo avere gli RNA anche degli enhancers.
08:23
Speaker A
Tuttavia, questi ultimi.
08:24
Speaker A
Diciamo, non sono tra i fondamentali.
08:25
Speaker A
Ma portano alla formazione di un condensato biomolecolare.
08:26
Speaker A
Nel momento in cui stiamo andando ad effettuare una trascrizione tramite l'RNA polimerasi di tipo 2.
08:27
Speaker A
Ok.
08:28
Speaker A
Quello che succede a questo punto.
08:29
Speaker A
È che per far sì che venga individuato.
08:30
Speaker A
E possa incominciare la trascrizione.
08:31
Speaker A
Ci sono dei fattori.
08:32
Speaker A
Di trascrizione generali.
08:33
Speaker A
Che sono fondamentali in questo meccanismo.
08:34
Speaker A
E si chiamano TF3B e TF3C.
08:35
Speaker A
Questi vanno a legarsi uno a livello del promotore A e l'altro a livello del promotore B intragenico.
08:36
Speaker A
Vanno ad eterodimerizzare tra di loro, formano un dimero, quindi l'unione di queste due subunità eterodimero, perché sono diverse tra di loro, se no sarebbero stati un omodimero.
08:37
Speaker A
E successivamente reclutano l'RNA polimerasi 3 e incominciano a trascrivere.
08:38
Speaker A
E cosa mi trascrivono?
08:39
Speaker A
Questo.
08:40
Speaker A
Questo RNA con la forma strana.
08:41
Speaker A
Ora.
08:42
Speaker A
Qua il mio 5' e qua ho il mio 3'.
Topics:trascrizioneeucariotiRNA polimerasifattori di trascrizioneregolazione genicamodifiche istonicheco-attivatorico-repressoriRNA messaggerocomplessi di rimodellamento

Frequently Asked Questions

Perché la regolazione della trascrizione dei geni è così importante negli eucarioti?

La regolazione della trascrizione è fondamentale perché la sua alterazione può causare gravi problemi. Ad esempio, un'eccessiva produzione di proteine può portare a malattie da accumulo, tumori (attivando oncogeni) o uno spreco di energia. Nelle cellule specializzate, può anche causare squilibri ormonali significativi.

Qual è la differenza tra elementi cis ed elementi trans nella trascrizione?

Gli elementi cis sono intrinseci al DNA, come il promotore o i potenziatori di trascrizione. Gli elementi trans, invece, sono un insieme di proteine che si inseriscono in queste regioni del DNA per regolare la trascrizione.

Come funzionano i fattori di trascrizione generali e quale ruolo hanno nella trascrizione?

I fattori di trascrizione generali formano una sorta di 'binario' sul DNA che permette all'RNA polimerasi (il 'treno') di posizionarsi e iniziare la trascrizione. Essi svolgono diverse funzioni, inclusa l'individuazione della zona di inserimento e la fosforilazione della coda CTD dell'RNA polimerasi, fornendo l'energia necessaria per il suo movimento.

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